In het water van de Drentse Aa worden soms te hoge concentratie bestrijdingsmiddelen gevonden. Drentse bollentelers spannen zich daarom in overschrijdingen tot een minimum te beperken door gebruik te maken van teeltvrije zones of door emissie te beperken.
In het drinkwater dat het Waterbedrijf Groningen uit de Drentsche Aa en haar zij takken haalt, worden te hoge concentraties bestrijdingsmiddelen gevonden. Om die belasting te verminderen, hebben Waterschap Hunze en Aa's, Waterbedrijf Groningen en de provincie Drenthe besloten maatregelen te nemen in de vorm van verschillende projecten. Een van die projecten is het project Verduurzaming bollenteelt Drentsche Aa. In dat project is aan bollentelers gevraagd stappen te nemen om de emissie van middelen naar het oppervlakte water te voorkomen.