In het CO2-sectorsysteem wordt de totale CO2-emissie van de glastuinbouwsector in beeld gebracht en vergeleken met de CO2-doelstelling. Bij een overschrijding van de jaarlijkse doelstelling worden de kosten van deze overschrijding verrekend met de individuele bedrijven op basis van het gasverbruik in het betreffende jaar. Op basis van het CO2-sectorsysteem komt de glastuinbouwsector in aanmerking voor het verlaagde belastingtarief op aardgas, wat jaarlijkse vele tienduizenden euro's scheelt in de bedrijfskosten. Tot nu toe heeft de glastuinbouwsector ieder jaar de CO2-doelstelling gehaald.
Meer informatie over het CO2-sectorsysteem is hier te vinden: Het CO2 sectorsysteem.